Nationella sekretariatet för genusforskning utgår från regeringens uppdrag till Göteborgs universitet att i ett rikstäckande perspektiv främja genusforskning. Av detta följer verksamhetens två ben:
Den senare punkten rör aktiviteter och journalistisk produktion, både på webben och genom tidningen Genus, för att på ett populärvetenskapligt och lättillgängligt sätt berätta om vad genusforskningen har att säga.
Den förra punkten handlar om forskningspolitik: Genom seminarier och hearings, journalistisk bevakning och utredningsrapporter, följer och analyserar sekretariatet den forskningspolitiska utvecklingen med särskilt fokus på dess relevans för genusforskningen.
I det forskningspolitiska arbetet samverkar sekretariatet på olika sätt med andra parter. Bland dessa kan nämnas motsvarigheterna i andra nordiska länder (Kilden i Norge, Kvinfo och Koordinationen för könsforskning i Danmark, Minna i Finland, med flera), Vetenskapsrådets Expertgrupp för genus, Sveriges genusforskarförbund och dess europeiska motsvarighet Atgender, samt myndigheten Vinnova.